banner
Nachrichtenzentrum
Ausgestattet mit erstklassiger Ausstattung

Allgemeiner Zugang zu Cubanen als Benzolbioisosteren

Jan 10, 2024

Natur (2023)Diesen Artikel zitieren

10.000 Zugriffe

29 Altmetrisch

Details zu den Metriken

Der Ersatz von Benzolringen durch sp3-hybridisierte Bioisostere in Arzneimittelkandidaten verbessert im Allgemeinen die pharmakokinetischen Eigenschaften bei gleichzeitiger Beibehaltung der biologischen Aktivität1,2,3,4,5. Starre, gespannte Gerüste wie Bicyclo[1.1.1]pentan und Cuban sind besonders gut geeignet, da die Ringspannung ihren CH-Bindungen eine hohe Bindungsstärke und damit metabolische Stabilität verleiht. Cuban ist das ideale Bioisoster, da es geometrisch am ehesten mit Benzol übereinstimmt6,7. Derzeit fungieren jedoch alle Cubane im Arzneimitteldesign, wie fast alle Benzol-Bioisostere, ausschließlich als Ersatz für einfach oder para-substituierte Benzolringe1,2,3,4,5,6,7. Dies ist auf die Schwierigkeit zurückzuführen, 1,3- und 1,2-disubstituierte Cuban-Vorläufer zugänglich zu machen. Die Übernahme von Cuban in die Arzneimittelentwicklung wurde zusätzlich durch die schlechte Kompatibilität von Kreuzkupplungsreaktionen mit dem Cuban-Gerüst aufgrund einer konkurrierenden metallkatalysierten Valenzisomerisierung behindert8,9,10,11. Hier berichten wir über zweckmäßige Wege zu 1,3- und 1,2-disubstituierten Cuban-Bausteinen unter Verwendung eines geeigneten Cyclobutadien-Vorläufers bzw. einer photolytischen C-H-Carboxylierungsreaktion. Darüber hinaus nutzen wir die langsame oxidative Addition und schnelle reduktive Eliminierung von Kupfer, um Kreuzkupplungsprotokolle für C–N, C–C(sp3), C–C(sp2) und C–CF3 zu entwickeln12,13. Unsere Forschung ermöglicht die einfache Umwandlung aller Cuban-Isomere in Arzneimittelkandidaten und ermöglicht so den idealen bioisosterischen Ersatz ortho-, meta- und para-substituierter Benzole.

Dies ist eine Vorschau der Abonnementinhalte, Zugriff über Ihre Institution

Greifen Sie auf Nature und 54 weitere Nature Portfolio-Zeitschriften zu

Holen Sie sich Nature+, unser preisgünstigstes Online-Zugangsabonnement

29,99 $ / 30 Tage

jederzeit kündigen

Abonnieren Sie diese Zeitschrift

Erhalten Sie 51 gedruckte Ausgaben und Online-Zugriff

199,00 $ pro Jahr

nur 3,90 $ pro Ausgabe

Leihen oder kaufen Sie diesen Artikel

Holen Sie sich diesen Artikel nur so lange, wie Sie ihn benötigen

39,95 $

Die Preise können örtlicher Steuern unterliegen, die beim Bezahlvorgang berechnet werden

Alle Daten sind im Haupttext oder in den Zusatzinformationen verfügbar.

Subbaiah, MAM & Meanwell, NA Bioisostere des Phenylrings: aktuelle strategische Anwendungen in der Leitstrukturoptimierung und im Arzneimitteldesign. J. Med. Chem. 64, 14046–14128 (2021).

Artikel CAS PubMed Google Scholar

Mykhailiuk, PK Gesättigte Bioisostere von Benzol: Wohin als nächstes? Org. Biomol. Chem. 17, 2839–2849 (2019).

Artikel CAS PubMed Google Scholar

Stepan, AF et al. Anwendung des Bicyclo[1.1.1]pentan-Motivs als nichtklassisches Phenylring-Bioisoster bei der Entwicklung eines wirksamen und oral wirksamen γ-Sekretase-Inhibitors. J. Med. Chem. 55, 3414–3424 (2012).

Artikel CAS PubMed Google Scholar

Gianatassio, R. et al. Aminierung unter Spannungsfreisetzung. Wissenschaft 351, 241–246 (2016).

Artikel ADS CAS PubMed PubMed Central Google Scholar

Zhang, X. et al. Kupfervermittelte Synthese wirkstoffähnlicher Bicyclopentane. Natur 580, 220–226 (2020).

Artikel ADS CAS PubMed PubMed Central Google Scholar

Eaton, PE Cubanes: Ausgangsstoffe für die Chemie der 1990er und des neuen Jahrhunderts. Angew. Chem. Int. Ed. 31, 1421–1436 (1992).

Artikel Google Scholar

Reekie, TA, Williams, CM, Rendina, LM & Kassiou, M. Cubanes in der medizinischen Chemie. J. Med. Chem. 62, 1078–1095 (2019).

Artikel CAS PubMed Google Scholar

Cassar, L., Eaton, PE & Halpern, J. Silber(I)- und Palladium(II)-katalysierte Isomerisierungen von Cuban. Synthese und Charakterisierung von Cunean. Marmelade. Chem. Soc. 92, 6366–6368 (1970).

Artikel Google Scholar

Cassar, L., Eaton, PE & Halpern, J. Katalyse symmetriebeschränkter Reaktionen durch Übergangsmetallverbindungen. Die Valenzisomerisierung von Cuban. Marmelade. Chem. Soc. 92, 3515–3518 (1970).

Artikel CAS Google Scholar

Plunkett, S., Flanagan, KJ, Twamley, B. & Senge, MO Hochgespannte tertiäre sp3-Gerüste: Synthese funktionalisierter Cubane und Untersuchung ihrer Reaktivität unter Pd(II)-Katalyse. Organometallics 34, 1408–1414 (2015).

Artikel CAS Google Scholar

Toriyama, F. et al. Redoxaktive Ester in der Fe-katalysierten C-C-Kupplung. Marmelade. Chem. Soc. 138, 11132–11135 (2016).

Artikel CAS PubMed PubMed Central Google Scholar

Le, C., Chen, TQ, Liang, T., Zhang, P. & MacMillan, DWC Ein radikaler Ansatz für das Problem der oxidativen Kupferaddition: Trifluormethylierung von Bromarenen. Wissenschaft 360, 1010–1014 (2018).

Artikel ADS CAS PubMed PubMed Central Google Scholar

Liang, Y., Zhang, X. & MacMillan, DWC Decarboxylative sp3 C-N-Kupplung über duale Kupfer- und Photoredoxkatalyse. Natur 559, 83–88 (2018).

Artikel ADS CAS PubMed PubMed Central Google Scholar

Lovering, F., Bikker, J. & Humblet, C. Flucht aus dem Flachland: Erhöhung der Sättigung als Ansatz zur Verbesserung des klinischen Erfolgs. J. Med. Chem. 52, 6752–6756 (2009).

Artikel CAS PubMed Google Scholar

Feng, Y., Liu, L., Wang, J.-T., Zhao, S.-W. & Guo, Q.-X. Homolytische C-H- und N-H-Bindungsdissoziationsenergien gespannter organischer Verbindungen. J. Org. Chem. 69, 3129–3138 (2004).

Artikel CAS PubMed Google Scholar

Levterov, VV, Panasyuk, Y., Pivnytska, VO & Mykhailiuk, PK Wasserlösliche nichtklassische Benzolmimetika. Angew. Chem. Int. Ed. 59, 7161–7167 (2020).

Artikel CAS Google Scholar

Denisenko, A., Garbuz, P., Shishkina, SV, Voloshchuk, NM & Mykhailiuk, PK Gesättigte Bioisostere von ortho-substituierten Benzolen. Angew. Chem. Int. Ed. 59, 20515–20521 (2020).

Artikel CAS Google Scholar

Zhao, J.-X. et al. 1,2-difunktionalisierte Bicyclo[1.1.1]pentane: seit langem gesuchte Mimetika für ortho/meta-substituierte Arene. Proz. Natl Acad. Wissenschaft. USA 118, e2108881118 (2021).

Artikel CAS PubMed PubMed Central Google Scholar

Epplin, RC et al. [2]-Ladderane als Isostere für meta-substituierte aromatische Ringe und versteifte Cyclohexane. Nat. Komm. 13, 6056 (2022).

Artikel ADS CAS PubMed PubMed Central Google Scholar

Iida, T. et al. Praktischer und einfacher Zugang zu Bicyclo[3.1.1]heptanen: wirksame Bioisostere meta-substituierter Benzole. Marmelade. Chem. Soc. 144, 21848–21852 (2022).

Artikel CAS PubMed Google Scholar

Kleinmans, R. et al. Intermolekulare [2π+2σ]-Photocycloaddition durch Triplett-Energietransfer. Natur 605, 477–482 (2022).

Artikel ADS CAS PubMed Google Scholar

Frank, N. et al. Synthese meta-substituierter Aren-Bioisostere aus [3.1.1]Propellan. Natur 611, 721–726 (2022).

Artikel ADS CAS PubMed Google Scholar

Rigotti, T. & Bach, T. Bicyclo[2.1.1]hexane durch durch sichtbares Licht gesteuerte intramolekulare gekreuzte [2+2]-Photocycloadditionen. Org. Lette. Rev. 24, 8821–8825 (2022).

Artikel CAS PubMed Google Scholar

Eaton, PE & Cole, TW Cubane. Marmelade. Chem. Soc. 86, 3157–3158 (1964).

Artikel CAS Google Scholar

Falkiner, MJ, Littler, SW, McRae, KJ, Savage, GP & Tsanaktsidis, J. Produktion von Dimethyl-1,4-cubandicarboxylat im Pilotmaßstab. Org. Prozessres. Entwickler 17, 1503–1509 (2013).

Artikel CAS Google Scholar

Biegasiewicz, KF, Griffiths, JR, Savage, GP, Tsanaktsidis, J. & Priefer, R. Cubane: 50 Jahre später. Chem. Rev. 115, 6719–6745 (2015).

Artikel CAS PubMed Google Scholar

Kassiou, M., Coster, M. & Gunosewoyo, H. Polyzyklische molekulare Verbindungen. Patent WO2008064432A1 (2008).

Wlochal, J., Davies, RDM & Burton, J. Cubanes in der medizinischen Chemie: Synthese funktionalisierter Bausteine. Org. Lette. 16, 4094–4097 (2014).

Artikel CAS PubMed Google Scholar

Chalmers, BA et al. Bestätigung von Eatons Hypothese: Cuban als Benzol-Bioisoster. Angew. Chem. Int. Ed. 55, 3580–3585 (2016).

Artikel CAS Google Scholar

Houston, SD et al. Das Cuban-Paradigma bei der Entdeckung bioaktiver Moleküle: weiterer Anwendungsbereich, Einschränkungen und die Cyclooctatetraen-Ergänzung. Org. Biomol. Chem. 17, 6790–6798 (2019).

Artikel CAS PubMed Google Scholar

Bernhard, SSR et al. Cuban-Kreuzkupplung und Cuban-Porphyrin-Arrays. Chem. EUR. J. 24, 1026–1030 (2018).

Artikel CAS PubMed Google Scholar

Okude, R., Mori, G., Yagi, A. & Itami, K. Programmierbare Synthese mehrfach arylierter Cubane durch CH-Metallierung und Arylierung. Chem. Wissenschaft. 11, 7672–7675 (2020).

Artikel CAS PubMed PubMed Central Google Scholar

Barborak, JC, Watts, L. & Pettit, R. Eine praktische Synthese des Cuban-Systems. Marmelade. Chem. Soc. 88, 1328–1329 (1966).

Artikel CAS Google Scholar

Brewer, CR, Sheehan, NC, Herrera, J., Walker, AV & McElwee-White, L. Photochemie von (η4-Dien)Ru(CO)3-Komplexen als Vorläuferkandidaten für die photounterstützte chemische Gasphasenabscheidung. Organometallics 41, 761–775 (2022).

Artikel CAS Google Scholar

Pettit, R. & Henery, J. Cyclobutadieneisentricarbonyl. Org. Synth. 50, 57–59 (1970).

Google Scholar

Masamune, S., Nakamura, N. & Sapadaro, J. 1,2-Bis(β-tosylethoxycarbonyl)diazen. Seine Anwendung auf das 2,3-Diazabicyclo[2.2.0]hexen-System. Marmelade. Chem. Soc. 97, 918–919 (1975).

Artikel CAS Google Scholar

Britten, TK, Akien, GR, Kemmitt, PD, Halcovitch, NR & Coote, SC Eine effiziente Herstellung von 1,2-Dihydropyridazinen durch eine Diels-Alder/Palladium-katalysierte Eliminierungssequenz. Tetraeder Lett. 60, 1498–1500 (2019).

Artikel CAS Google Scholar

Altman, LJ, Semmelhack, MF, Hornby, RB & Vederas, JC Photochemische Isomerisierung von Dimethyl-1,2-dihydropyridazin-1,2-dicarboxylat. Chem. Komm. 1968, 686–687 (1968).

Google Scholar

Britten, TK, Kemmitt, PD, Halcovitch, NR & Coote, SC 4-π-Photocyclisierung von 1,2-Dihydropyridazinen: ein Ansatz für bicyclische 1,2-Diazetidine mit großem Synthesepotenzial. Org. Lette. 21, 9232–9235 (2019).

Artikel CAS PubMed Google Scholar

Bashir-Hashemi, A. Photochemische Carboxylierung von Cubanen. Angew. Chem. Int. Ed. 32, 612–613 (1993).

Artikel Google Scholar

Collin, DE, Kovacic, K., Light, ME & Linclau, B. Synthese von ortho-funktionalisierten 1,4-Cubandicarboxylat-Derivaten durch photochemische Chlorcarbonylierung. Org. Lette. 23, 5164–5169 (2021).

Artikel CAS Google Scholar

Chan, AY et al. Metallaphotoredox: die Verschmelzung von Photoredox- und Übergangsmetallkatalyse. Chem. Rev. 122, 1485–1542 (2022).

Artikel CAS PubMed Google Scholar

Rodríguez, N. & Gooßen, LJ Decarboxylierende Kupplungsreaktionen: eine moderne Strategie für die Bildung von C-C-Bindungen. Chem. Soc. Rev. 40, 5030–5048 (2011).

Artikel PubMed Google Scholar

Ruiz-Castillo, P. & Buchwald, SL Anwendungen palladiumkatalysierter C-N-Kreuzkupplungsreaktionen. Chem. Rev. 116, 12564–12649 (2016).

Artikel CAS PubMed PubMed Central Google Scholar

Hartwig, JF Entwicklung eines Katalysators der vierten Generation für die Aminierung und Thioetherifizierung von Arylhalogeniden. Acc. Chem. Res. 41, 1534–1544 (2008).

Artikel CAS PubMed PubMed Central Google Scholar

Zhao, W., Wurz, RP, Peters, JC & Fu, GC Photoinduzierte, kupferkatalysierte decarboxylierende C-N-Kupplung zur Erzeugung geschützter Amine: eine Alternative zur Curtius-Umlagerung. Marmelade. Chem. Soc. 139, 12153–12156 (2017).

Artikel CAS PubMed PubMed Central Google Scholar

Sodano, TM, Combee, LA & Stephenson, CRJ Jüngste Fortschritte und Ausblick für den isosterischen Ersatz von Anilinen. ACS Med. Chem. Lette. 11, 1785–1788 (2020).

Artikel CAS PubMed PubMed Central Google Scholar

Sklyarova, AS et al. Herstellung und Prüfung von Homocubylaminen als therapeutische NMDA-Rezeptorantagonisten. Med. Chem. Res. 22, 360–366 (2013).

Artikel CAS Google Scholar

Sakai, HA, Liu, W., Le, C. & MacMillan, DWC Kreuzelektrophile Kopplung von nicht aktivierten Alkylchloriden. Marmelade. Chem. Soc. 142, 11691–11697 (2020).

Artikel CAS PubMed PubMed Central Google Scholar

Referenzen herunterladen

Wir danken Z. Dong, P. Sarver, Y. Liang, C. Oswood, W. Liu und M. Heilmann für Diskussionen; I. Pelcer und K. Conover für Unterstützung bei der NMR-Spektroskopie; R. Lambert für seine Unterstützung bei der Erstellung dieses Artikels; J. Piesvaux, JP Imredy, RL Kraus und B. Lacey für Hilfe bei der Erstellung biologischer Profile; und A. Beard, M. Darlak, S. McMinn, L. Nogle, M. Pietrafitta, D. Smith und Y. Ye (alle Merck & Co., Inc.) für Hilfe bei der Umkehrphasenchromatographie. Die Forschung wurde vom NIH National Institute of General Medical Sciences (NIGMS), dem NIH (R35GM134897-03), der Princeton Catalysis Initiative und freundlichen Geschenken von Merck & Co., Inc., Bristol-Myers Squibb (BMS) unterstützt. Celgene, Genentech, Janssen Research and Development LLC und Pfizer. MPW wurde von der Deutschen Akademie der Naturforscher Leopoldina gefördert (LPDS 2018-16). FB wurde von der Deutschen Forschungsgemeinschaft (DFG) gefördert – 421436809, und JD wurde durch ein SNSF Early Postdoc.Mobility-Stipendium unterstützt.

Diese Autoren haben gleichermaßen beigetragen: Mario P. Wiesenfeldt, James A. Rossi-Ashton, Ian B. Perry

Merck Center for Catalysis an der Princeton University, Princeton, NJ, USA

Mario P. Wiesenfeldt, James A. Rossi-Ashton, Ian B. Perry, Johannes Diesel, Olivia L. Garry, Florian Bartels und David WC MacMillan

Lancaster University, Lancaster, Großbritannien

Susannah C. Coote

Abteilung für Entdeckungschemie, Merck & Co., Inc., Boston, MA, USA

Xiaoshen Ma, Charles S. Yeung und David J. Bennett

Sie können diesen Autor auch in PubMed Google Scholar suchen

Sie können diesen Autor auch in PubMed Google Scholar suchen

Sie können diesen Autor auch in PubMed Google Scholar suchen

Sie können diesen Autor auch in PubMed Google Scholar suchen

Sie können diesen Autor auch in PubMed Google Scholar suchen

Sie können diesen Autor auch in PubMed Google Scholar suchen

Sie können diesen Autor auch in PubMed Google Scholar suchen

Sie können diesen Autor auch in PubMed Google Scholar suchen

Sie können diesen Autor auch in PubMed Google Scholar suchen

Sie können diesen Autor auch in PubMed Google Scholar suchen

Sie können diesen Autor auch in PubMed Google Scholar suchen

MPW und IBP entwickelten den Weg zu Dimethylcuban-1,3-dicarboxylat. OLG, MPW und JAR-A. entwickelten den Weg zu 1-tert-Butyl-2-methylcuban-1,2-dicarboxylat. JAR-A. und IBP entwickelten die Aminierungsreaktion, JD und MPW entwickelten die Alkylierungsreaktion, MPW, FB und JD entwickelten die Arylierungsreaktion und JAR-A. und FB entwickelte die Trifluormethylierungsreaktion. JAR-A. wandten die Reaktionen auf neue Cuban-Isomere an und synthetisierten die Arzneimittelanaloga. Biologische Tests wurden von XM, CSY und DJBDWCM durchgeführt, SCC, XM, CSY und DJB gaben Ratschläge. DWCM, MPW, JAR-A., IBP und JD haben den Artikel mit Beiträgen aller Autoren verfasst. DWCM leitete das Projekt.

Korrespondenz mit David WC MacMillan.

DWCM erklärt eine Eigentumsbeteiligung am Penn PhD-Photoreaktor, der in dieser Arbeit zur Bestrahlung von Reaktionen verwendet wird. Die anderen Autoren erklären keine konkurrierenden Interessen.

Nature dankt Kaid Harper und den anderen, anonymen Gutachtern für ihren Beitrag zum Peer-Review dieser Arbeit.

Anmerkung des Herausgebers Springer Nature bleibt hinsichtlich der Zuständigkeitsansprüche in veröffentlichten Karten und institutionellen Zugehörigkeiten neutral.

Diese Datei enthält allgemeine Informationen, experimentelle Verfahren, Charakterisierungsdaten, erweiterte Informationen und ergänzende Abbildungen. 1–36, NMR-Spektren und Referenzen.

Springer Nature oder sein Lizenzgeber (z. B. eine Gesellschaft oder ein anderer Partner) besitzen die ausschließlichen Rechte an diesem Artikel im Rahmen einer Veröffentlichungsvereinbarung mit dem Autor bzw. den Autoren oder anderen Rechteinhabern. Die Selbstarchivierung der akzeptierten Manuskriptversion dieses Artikels durch den Autor unterliegt ausschließlich den Bedingungen dieser Veröffentlichungsvereinbarung und geltendem Recht.

Nachdrucke und Genehmigungen

Wiesenfeldt, MP, Rossi-Ashton, JA, Perry, IB et al. Allgemeiner Zugang zu Cubanen als Benzolbioisosteren. Natur (2023). https://doi.org/10.1038/s41586-023-06021-8

Zitat herunterladen

Eingegangen: 20. Januar 2023

Angenommen: 27. März 2023

Veröffentlicht: 04. April 2023

DOI: https://doi.org/10.1038/s41586-023-06021-8

Jeder, mit dem Sie den folgenden Link teilen, kann diesen Inhalt lesen:

Leider ist für diesen Artikel derzeit kein Link zum Teilen verfügbar.

Bereitgestellt von der Content-Sharing-Initiative Springer Nature SharedIt

Durch das Absenden eines Kommentars erklären Sie sich damit einverstanden, unsere Nutzungsbedingungen und Community-Richtlinien einzuhalten. Wenn Sie etwas als missbräuchlich empfinden oder etwas nicht unseren Bedingungen oder Richtlinien entspricht, kennzeichnen Sie es bitte als unangemessen.